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FLUOPATH
Single-cell fluorescence-based analysis to develop biomarkers used to better predict stress resistance and virulence of pathogenic bacteria in dairy products
Le projet FLUOPATH vise à développer des biomarqueurs fluorescents chez deux bactéries pathogènes pour mieux prévoir l’impact du procédé alimentaire sur leur survie et leur virulence dans les produits laitiers.
Résumé du projet
| Période | 2024 – 2028 |
| Type de projet | Projet collaboratif |
| Axes scientifiques ADRIA associés | Reproduction des contaminations naturelles ; Simulation des phénomènes biologiques et physico-chimiques |
| Thématique principale | Utilisation de biomarqueurs fluorescents pour évaluer la réponse au stress et la virulence de bactéries pathogènes |
| Partenaires | UMR PAM (coordinateur), ADRIA, AERIAL, CNIEL, LUBEM, SECALIM, SQPOV |
| Financement | ANR |
| Contacts ADRIA | Agathe Dutoit, Yvan Le Marc |
Objectifs du projet
Le principal objectif du projet FLUOPATH est d’identifier de nouveaux biomarqueurs (promoteurs induisant l’expression de gènes d’intérêt), associés à un biosenseur fluorescent, afin d’acquérir de nouvelles connaissances sur l’état physiologique de deux pathogènes (Listeria monocytogenes et Bacillus cereus) en milieux laitiers (lait, fromage modèle dilué, et si possible, fromage modèle solide), en lien avec l’impact de perturbations technologiques. In fine, ces données, croisées avec les connaissances issues de la littérature scientifique, permettront d’améliorer les modèles de prévision du risque microbiologique dans les produits laitiers.
Approche et travaux menés
Le projet est organisé en 4 lots :
- Développement de modèles prédictifs de la résistance aux stress et virulence des bactéries pathogènes
- Détermination des phénotypes d’intérêt
- Identification des ARNm spécifiques aux phénotypes observés
- Élaboration de mutants fluorescents
L’articulation entre ces différentes phases du projet est illustrée par la figure ci-dessous :
Ce que le projet apporte aux filières agroalimentaires
Le projet FLUOPATH permettra l’amélioration de la prévision des risques microbiologiques dans les produits laitiers en prenant en compte l’effet des stress environnementaux (acide, froid).
Partenaires du projet
Consortium – Partenaires : 7 partenaires, membres du RMT ACTIA QUALIMA, sont impliqués dans ce projet :
- CNIEL : Karine Le Barillec, Fanny Tenenhaus-Aziza
- UMR PAM : Stéphane Guyot, Jean-Marie Perrier
- UMR SECALIM : Sandrine Guillou, Ph.D, HDR, Nabila Haddad, Agnès Bouju, Sandrine Rezé
- LUBEM : Noémie Desriac, Clément Trunet, Anne-Gabrielle Mathot
- UMR SQPOV : Sandrine Poncet, Véronique Broussolle, Marie-Hélène Guinebretière, Stéphanie Oriol, Bénédicte Doublet
- AERIAL : Valérie Stahl, Lysiane Omhover (Fougy), Bernard Hezard, Adrienne Lintz
- ADRIA : Yvan Le Marc, Agathe Dutoit